主讲人简介:杜联明,博士,成都大学特聘副研究员。毕业于四川大学生物信息学专业,主要从事基因组学与转录组学研究,生物信息学数据库和数据分析软件开发。相关成果发表在Bioinformatics,Molecular Ecology Resources,Aging,Journal
of Heredity,Genome Research,Molecular Biology and Evolution等国际知名期刊上。
主讲内容:序列比对是生物信息学的基本组成和重要基础,也是最常用和最经典的研究手段。基于生物学中序列决定结构,结构决定功能的普遍规律,可以利用比对进行序列同源性搜索,发现生物序列中的结构、功能和进化信息。串联重复序列是基因组重要的组成元件,可用于开发分子标记。讲解内容包括:基于动态规划算法计算两条序列之间的最小编辑距离(Levenshtein Distance),全局比对Needleman-Wunsch算法和局部比对Smith-Waterman算法,以及利用这些算法进行回绕比对识别非完美型串联重复序列。
时间:6月28日(星期五)9:00
地点:综合楼B340
主办单位:高等研究院